重庆市畜牧科学院系重庆市以畜牧业产前、产中、产后的关键技术和共性技术为主要研究领域的畜牧科学创新中心、合作中心和高级科技人才培养基地。其方向任务是承担畜牧兽医基础研究、应用技术研究、产业化战略研究，开展畜牧兽医技术培训、学术交流，从事技术推广、科技兴农、成果转化，促进农民增收和畜牧业可持续发展。

    全院拥有“农业部种猪质量监督检验测试中心（重庆）”，“农业部养猪科学重点实验室”，“博士后科研工作站”，“品种资源保护场（重庆市种猪场）”，“重庆市养猪工程技术研究中心”，“重庆畜牧科技城科技孵化基地”等23个科技创新平台。建有养猪研究所、动物营养研究所等10个科研机构和武隆、南川、云阳、酉阳4个分院。全院现有职工504人，具有高、中级技术职称131人，拥有博士、硕士76人。拥有享受特殊津贴的专家、首批“新世纪百千万人才工程人选”、重庆市学术技术带头人及后备人选和西部突出贡献专家共计16人。“十五”以来获得国家和部、省级科技成果奖71项，发表学术论文700余篇，出版专着31部，获准知识产权32项，获得专有产品证书148个。

    全院占地面积1060余亩，拥有试验基地3000多亩。创办有市级农业产业化龙头企业“重庆泰华牧业（集团）有限公司”，建有档次、西部规模的畜牧市场“西部饲料兽药畜产品批发交易市场”，投资组建了14个畜牧科技型企业。

    重庆市畜牧科学院的发展目标是 “国内、”。