水产养殖会破坏水质在人们映像中根深蒂固，而根据多次测试，苏州市阳澄湖大闸蟹行业协会大部分会员以及当地专家学者认为在阳澄湖适当养殖大闸蟹有利于改善阳澄湖水质。
阳澄湖大闸蟹盛名在外，吸引大量外地人员前来购买，养活了数以万计的蟹农；而阳澄湖则是苏州老百姓喝水的第二水源地，具有极大的意义和生态意义。经济效益和生态效益，如何协调？为此，农业部提出了“净水渔业”。所谓净水渔业就是湖水经水产养殖后，其排出的氮、磷、碳小于水源的氮、磷、碳。而净水渔业的核心是采用生物修复技术，达到“以鱼保水，以渔净水”的目的。具体操作上，需要通过控密度，种水草等方法，来使水产养殖和生态保护达到一个平衡点。
近日，正谷阳澄湖大闸蟹生态养殖合作社也介绍了他们的做法。合作社的2000亩养殖水面，水浅底硬、水草丰茂、水质清澈透明，养出的大闸蟹也质量过硬。他们坚持主要通过在阳澄湖养殖水域增养增殖花白鲢等滤食性鱼类，来控制蓝藻的爆发，既保持水生态平衡，又利用了水体的渔产力。另外，通过降低大闸蟹的放养密度、培植水草、投施鱼虾、螺蛳等天然饵料、适时捕捞等一系列生态养殖技术的应用，营造有益于大闸蟹健康生长的生态环境，实现生态效益和养殖效益的良性循环。